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2001年
2月26日，微软公司被控违反反垄断法一案，进入上诉程序的法庭辩论阶段。在整整两天里，哥伦比亚特区上诉法院的7名法官全体出席听审（平时是3名）。
2月27日，在联邦上诉法院进行了为期两天的针对哥伦比亚地方法官裁决的唇枪舌剑般的争斗，法官对拆分微软的裁决提出了质疑，虽然他认定微软的确违反了反托拉斯法。
3月14日，法官托马斯-杰克逊要求自己退出对微软种族歧视案件的审理工作。
4月19日，欧盟驳回了一项关于针对微软在数字有线电视方面违反反托拉斯法的指控，此前微软对部分业务合同进行了修改。
7月28日，联邦上诉法院否决了地方法院对微软进行拆分的决定，但认定微软的确违反了美联邦反托拉斯法。该法院还把该案交给了另外一名法官进行处理。
8月24日，联邦上诉法院把微软垄断案送回地方法院审理，同时任命了一个新的法官负责此案的工作，并由他决定是否对微软实施治裁。
8月，欧洲委员会警告说，微软在Windows操作系统中捆绑Media Player播放软件可能触犯了欧盟的反垄断法。此外，微软还涉嫌采用“非法的行为”将其在个人电脑领域的垄断向服务器领域扩展。
9月6日，地区法院女法官科琳·科拉尔－科特利8月24日接手微软一案后，起诉微软的美国司法部突然宣布，将不再寻求通过分割的方式来处罚微软，同时司法部还撤销了有关微软非法地将其网络浏览器和“视窗”操作系统捆绑在一起的指控，使这一历史性的反托拉斯案件出现了新的转折。
9月20日，美国司法部和18个州敦促联邦法官，在2月4日举行限制微软商业垄断行为、矫正Windows XP法庭听证会。
9月24日，美国六个州的司法部长加入到支持政府反微软垄断的队伍中。
10月9日，美国最高法院作出决定，驳回微软公司要求最高法院否决联邦地区法院法官托马斯·杰克逊关于该公司是一家违法垄断公司的判决的请求。
10月，美国司法部和微软达成调解协议。
11月6日，美国微软公司反垄断案中作为原告的18个州中有9个州同意接受微软公司与美国司法部达成的调解协议，但其他州却表示要把这场官司进行到底。
11月，欧洲委员会的竞争委员表示，欧盟将于12月份开庭审理微软是否在欧洲采取了非法的反竞争行为，预计将在明年初裁决微软是否违犯了欧盟的反垄断法。
11月20日，微软与原告就众多的民间集体反垄断诉讼达成和解。预计微软将为此付出10亿美元的代价。有许多民间团体都起诉了微软，认为微软涉嫌非法利用其在个人电脑操作系统市场上的垄断地位使数以百万计的用户为他们使用的电脑和软件支付了过高的费用。
12月6日，美国苹果计算机公司席执行官史蒂夫·乔布斯表示，微软公司赠送给学校价值数亿美元的计算机软硬件，实际价值不到１００万美元，大大低于微软声称的５亿到８．３亿美元。而且，微软有借机将垄断范围扩充到教育系统的嫌疑。
12月7日，在提出的赔偿诉讼中，州政府的检察官们要求美国地区法院法官Colleen Kollar-Kotelly接受苛刻的处罚，这在反托拉斯法术语中被称为'皇冠上的宝石'条款。赔偿诉讼要求微软公开IE网络浏览器的源代码，进而还可能要求其公布Windows 操作系统的源代码。州政府方面提出的其他诉求还包括： 微软必须对PC制造商和其他公司执行统一和非歧视的Windows授权政策；向软件开发商全面公开应用程序接口（APIs）；禁止微软格式合同中的单一性条款和报复行为；在Windows中提供Sun版本的Java，期限为10年。
12月，继续起诉微软的各州对如何处置微软达成共识，决定请求主审法官要求微软提供一套低价的不捆绑任何微软软件的Windows操作系统。作为对微软反垄断案解决方案的一部分，继续起诉微软的9个州表示，将向地区法官提出该项请求。各州同时还将要求微软向其他软件制造商开放Windows操作系统的源代码，要求微软的WindowsXP操作系统要支持Sun公司的Java编程语言，同时还要确保微软的Office软件与其他软件平台相兼容。
12月13日，微软拒绝接受9个州提出的矫正提议。
12月31日，继续寻求对微软公司施加更为严厉制裁的九个州督促联邦法官拒绝微软公司延迟举行听证会的要求。这九个洲是加州、康乃狄克州、佛罗里达州、爱荷华州、堪萨斯州、麻省、明尼苏达州、犹他州、西维吉尼亚州以及哥伦比亚特区。
2002年
1月8日消息，美国联邦法官正式拒绝微软延期举行听证会请求，3月11日的听证会将如期举行。
1月22日，美国在线时代华纳旗下所属的Netscape Communications对微软提出控诉，声称微软以不当竞争手段排挤Netscape浏览器，要求微软赔偿巨额损失。
4月3日，全球软件巨擘微软公司总裁兼首席运营官（President ＆ COO）里克·贝卢佐突然宣布将于5月1日辞职，同时微软公布了重大的业务结构调整计划。此举将使微软更方便地转变为复合型公司，以应对政府的反垄断。
4月22日，比尔·盖茨将于亲自出庭为微软辩护，以试图使公司免于9个州的司法部长提出的严厉的反垄断制裁方案。这是盖茨在长达4年的微软反垄断案审理过程中首次出庭作证。
5月，欧盟委员会着手调查微软公司从互联网上获取用户个人信息是否违反与隐私相关的法律。欧盟执委会明确指出，欧盟下一步将对微软.NET Passport服务展开全面调查，同时欧盟还将进一步关注微软将其媒体播放软件与操作系统的捆绑发行等事宜。先前，欧盟已经对微软的Windows操作系统在与自身的服务器软件的兼容性上优于其他竞争对手、涉嫌在操作系统上的垄断行为展开了全面的调查。
5月，“台湾公平交易委员会”成立特别小组开始对微软的商业行为展开调查，以确定这家软件业巨头是否滥用了其占据的市场垄断地位，任意提高产品的价格。成立于１９９２年的台湾公平交易委员会，主要负责起草维护公平交易的政策，法律和规定，调查和处理垄断、合并等各种妨碍市场竞争的举动，以及企业旨在限制市场竞争的不正当商业行为。
6月12日，华盛顿哥伦比亚特区地方法院拒绝接受微软公司的驳回９个州和哥伦比亚特区对其提出的反托拉斯诉讼的请求。
8月5日，微软表示，将于未来几个星期中公布将近400段曾经属于“高度机密”的WINDOWS操作系统源程序代码，以及其他相关的程序开发内部操作规则，以便执行其去年同美国司法部达成的“反托拉斯”协议。
9月，美国佛罗里达州的一位法官日前正式批准对软件业巨头微软公司发起集团诉讼，并称微软的商业手法违反了美国反托拉斯法（反垄断）的相关规定。除佛罗里达州的这桩诉讼外，微软在其他各州也陷入了人人喊打的尴尬局面。在加利福尼亚州、亚利桑那、南、北达科他州，维斯康星，堪萨斯州和明尼苏达州类似的诉讼都已经发生。
11月1日，美国联邦地区法官科琳·科拉尔·科特利宣布，同意美国微软和美国司法部达成的反托拉斯和解协议的绝大部分内容。此次判决内容表明，微软的市场垄断地位至少在未来5年内有了法律保证。
11月，由微软的竞争对手Sun微系统和甲骨文出资赞助的计算机与通信产业协会（the Computer and Communications Industry Association ）和软件与信息产业协会（the Software and Information Industry Association）对科拉尔·科特利法官的裁决提出上诉。同时另外两家组织计算选择消费者组织（the Consumers for Computing Choice）和开放平台工作组（the Open Platform Working Group ）也向法院递交文件，要求允许他们介入，以便对微软与司法部达成的和解放方案提出上诉。
11月30日，马萨诸塞州司法部长汤姆·赖利在波士顿出席新闻发布会时称，该州将独自对联邦法官批准美国司法部与微软公司反垄断案和解协议的判决提出上诉。赖利表示，判决不足以保护消费者免受微软肆意行为的损害，并称微软在科技领域的垄断地位限制了竞争和消费者的选择，对美国整体经济构成了更大范围的威胁。
12月19日，欧盟反托拉斯主席在布鲁塞尔发表的评论中表示，欧盟将于2003年初完成针对微软长达3年之久的调查。欧盟调查人员指控微软滥用公司Windows软件在个人电脑操作系统市场中的主导地位，并将这种主导地位渗透到与媒体和服务器软件相关的市场中，与之相比，美国微软案件主要集中在互联网浏览器和该公司与硬件商的关系上。
12月23日，美国联邦地方法院法官弗雷德里克·摩兹裁定，微软公司必须在其Windows操作系统中发布与其竞争的Java编程语言。在弗雷德里克负责审理Sun公司提起的针对微软公司的反垄断诉讼期间，这一初步性的裁定将一直有效。 Sun公司指控称，微软公司破坏其Java软件的目的是为了抵消它对其Windows垄断地位的威胁。Sun公司还要求弗雷德里克在制定对微软公司触犯反垄断法案的制裁措施时，应当考虑强制微软公司“必须捆绑”Java编程语言的条款。微软随后对此提出了上诉。（反微软垄断博客同盟）
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